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Academic Year/course: 2019/20

537 - Master's in Molecular and Cellular Biology

66030 - Advanced methods in molecular and cellular biology


Syllabus Information

Academic Year:
2019/20
Subject:
66030 - Advanced methods in molecular and cellular biology
Faculty / School:
100 - Facultad de Ciencias
Degree:
537 - Master's in Molecular and Cellular Biology
ECTS:
6.0
Year:
1
Semester:
First semester
Subject Type:
Compulsory
Module:
---

1. General information

1.1. Aims of the course

The overall objective of this subject is to deepen the student's knowledge on manipulation techniques and analysis of genetic material, collection, purification and characterization of proteins, immunology, cell culture, electron microscopy, electrochemical sensors, as well as the most important applications of these techniques. This objective will be acquired through lectures, solving practical cases in the classroom and presentation of papers.

With the development of personal work it is intended to deepen students' prior knowledge and acquire additional skills related to finding information and critical analysis, writing and communication of scientific content, etc.

1.2. Context and importance of this course in the degree

All work is aimed to make the students know delve into the latest advances in techniques of molecular and cellular biology.

1.3. Recommendations to take this course

To follow this course, the student must have a basic knowledge of Molecular and Cellular Biology techniques including those related to the analysis of genes and proteins and the identification of cells and organelles.

2. Learning goals

2.1. Competences

After passing this course, the students will be:
1. Competent to design the most appropriate methodology to answer the questions presented in the field of Molecular and Cellular Biology.
2. Able to assess the relevance of developments in the field.
3. Capable to search and critically analyze specific information.
4. Competent for presentations and exhibitions of issues related to technology Molecular and Cell Biology.
5. Able to identify the most appropriate strategy to achieve the best result to solve a particular problem in the field of molecular and cellular biology techniques.

2.2. Learning goals

For passing this subject, the student should demonstrate to be able to:

 

- Assess of the relevance of developments in the field.

- Planning the molecular cloning of a gene, site-directed mutagenesis experiments, genetic analysis of diseases, functional study, propose methods to use, carry them out, and interpretation of the results.

- Searching, analysis and transmission of information on specific aspects of molecular and cell biology.

- Solve specific problems that might arise in a laboratory of molecular and cellular biology

- Present its work 

2.3. Importance of learning goals

As a result of following this course, students will be able to select the most appropriate technique when addressing a problem to solve in the identification and analysis of cells, genes, proteins or metabolites. In turn it will know how to tackle more efficiently the characterization of the different cells and biomolecules.

3. Assessment (1st and 2nd call)

3.1. Assessment tasks (description of tasks, marking system and assessment criteria)

The student must demonstrate that he/she has achieved the intended learning outcomes through the following evaluation activities

1. Active participation in seminars, theoretical and case study sessions. It is scored from 0 to 10 and will contribute 15% to the final grade.

2. Presentation of an individual work

Work will focus on a topic related to the subject, each student take shape with the teacher. The work must be in writing and signed by the student.

Evaluation criteria and levels of demand:

The presentation of a written work will be required to pass the course. It is scored from 0 to 10 and will contribute 35% to the final grade. The evaluation criteria are as follows:

Consistency of information.

Clarity of concepts.

Degree of preparation of the presentation.

Degree of internalisation of content with critical analysis and own suggestions. 

3. Making an objective test

The test consists of a series of multiple choice questions about the theoretical contents of the subject.

The test consists of 20 multiple choice questions on the content of the theoretical program of the subject. It is scored from 0 to 10 and will contribute 50% to the final grade

The objective test will take place the day and time indicated in the Moodle platform of the University of Zaragoza https://moodle2.unizar.es/add/ and the moodle of the subject.

TO APPROVE THE SUBJECT IS AN ABSOLUTE REQUIREMENT to pass this test WITH A MINIMUM OF 5 points out of a total of 10.

 In addition, to pass this subject, students must achieve a minimum overall score of 5 out of a total of 10.

For those students who have to appear in successive calls for not having passed the subject on first call, the evaluation will consist of the same tests for students in first call, with the following features:

Students who in previous calls have obtained at least 5 points in the presentation of individual work will not have the obligation to submit a new job.

The date and place of different to the first calls will be announced in the Moodle platform of the University of Zaragoza https://moodle2.unizar.es/add/.

4. Methodology, learning tasks, syllabus and resources

4.1. Methodological overview

This course is designed to address the learning of theoretical knowledge with different specialists. To achieve this goal, in the lectures a large number of teachers, with different backgrounds, is involved  to allow students a wider vision of the field.

This strategy will allow the students to review a topic in detail with the supervision of an outstanding professional, who can provide further professional development in the field, when choosing and carry out their thesis project.

4.2. Learning tasks

The course includes the following learning tasks:

 

1. Classroom activities: Lectures, presentation and discussion of practical cases (30 hours). Participatory lectures. Basic theoretical knowledge of the course is presented to students. The last 2 sessions will be dedicated to solve practical cases.

2. Seminars (10 hours).

3. Presentation of an assignment (30 hours). Autonomous work. In this activity students should collect information on a particular topic, helped by the teacher. The teacher will monitor the individual work of students by scheduling tutoring sessions. Finally, the assignment will be presented to the teacher.

3. Tutorials (10 hours).

4. Assessment. Objective test lasts 1 hour. 40 hours of autonomous work.

4.3. Syllabus

The course will address the following topics:

1. Presentation. Introduction to Molecular / Cellular Biology and its applications. Critical analysis of technologies for nucleic acid research.

2. Functional analysis of promoters. Techniques for the study of DNA-protein interaction. Applications.

3. Bacterial regulators: study methods

4. Transcriptional regulators as antimicrobial targets

5. Vaccines in the 21st century

6. Applications of Flow Cytometry

7. Multidimensional optical microscopy

8. Methods of studying the miRNAs. Applications.

9. Two-component systems

10. Proteomics / immunochemistry techniques

11. New techniques of DNA sequencing

12. OxPhos function analysis. Generation of mutants in mitochondrial DNA. Polarography Mitochondrial synthesis of proteins (35S)

13. Mitochondrial proteomics through gene capture (Gene-trap)

14. Organ on chip: Microfluidic devices to simulate the microenvironment in in vitro cancer models

15. Epigenetics: Concepts, analysis techniques and biomedical applications

16. Practical cases

 

IMPORTANT: The order of the topics may change depending on the agendas of visiting researchers.

Coordinator: Dr. Maria F. Fillat

 

 

4.4. Course planning and calendar

Lectures, case studies and seminars:

First Semester,  (the course will begin during the second half of October)

Hours: 16:00 to 18:00 h.

Location: It will be indicated on the Faculty of Science website.

 

During the teaching period, students may contact the teachers who presented their topic of interest to select their assignement.

Deadline for submission of written assignments: Last school day before Christmas vacation.

Supervision and assignment review: to be informed in class.

 

Theoretical lessons, case studies and seminars: First semester. Timing: from 16 to 18h.

Deadline for submission of written work: last school day before Christmas holiday

Tutorials: Will be announced at the beginning of the course

4.5. Bibliography and recommended resources

Bibliographic records for this subject will be indicated along each theoretical session

Slides of lessons will be available in the Moodle platform at UNIZAR


Curso Académico: 2019/20

537 - Máster Universitario en Biología Molecular y Celular

66030 - Técnicas avanzadas en biología molecular y celular


Información del Plan Docente

Año académico:
2019/20
Asignatura:
66030 - Técnicas avanzadas en biología molecular y celular
Centro académico:
100 - Facultad de Ciencias
Titulación:
537 - Máster Universitario en Biología Molecular y Celular
Créditos:
6.0
Curso:
1
Periodo de impartición:
Primer semestre
Clase de asignatura:
Obligatoria
Materia:
---

1. Información Básica

1.1. Objetivos de la asignatura

La asignatura y sus resultados previstos responden a los siguientes planteamientos y objetivos:

Esta asignatura, como integrante del Master Universitario en Biología Molecular y Celular, se ofrece a sus estudiantes para ampliar conocimientos en técnicas de laboratorio de Biología Molecular y Celular, planteando un nivel de conocimiento próximo al del especialista.

Su objetivo general es profundizar en técnicas de manipulación y análisis de material genético, obtención, purificación y caracterización de proteínas, inmunología, cultivos celulares, microscopía electrónica, sensores electroquímicos, así como en las aplicaciones más relevantes de estas técnicas. Este objetivo se adquirirá a través de clases teóricas, resolución de casos prácticas en el aula y presentación de trabajos.

Con la elaboración de un trabajo personal se pretende que los alumnos profundicen en los conocimientos previos y adquieran competencias adicionales relacionadas con la búsqueda de información y su análisis crítico, redacción y comunicación de contenidos científicos, etc.

1.2. Contexto y sentido de la asignatura en la titulación

Todo el trabajo está encaminado a conseguir que el alumno conozca y profundice en los últimos avances en técnicas de Biología molecular y celular.

1.3. Recomendaciones para cursar la asignatura

Disponer de conocimientos básicos de Biologia Molecular y Celular y de las técnicas de identificación de células, organelos, así como de análisis de genes y proteínas.

2. Competencias y resultados de aprendizaje

2.1. Competencias

Al superar la asignatura, el estudiante será más competente para...

Al superar la asignatura, el estudiante será:

  1. Competente para diseñar la metodología mas adecuada que pueda responder a la preguntas planteadas en el campo de la Biología Molecular y Celular.
  2. Capaz de valorar la relevancia de los avances del campo.
  3. Apto para  buscar y analizar de forma crítica información específica.
  4. Competente para realizar presentaciones y exposiciones de temas relacionados con tecnología de la Biología Molecular y Celular.
  5. Capaz de identificar la técnica más apropiada para conseguir el mejor resultado para resolver un determinado problema en el campo de la Biología molecular y celular.

2.2. Resultados de aprendizaje

El estudiante, para superar esta asignatura, deberá demostrar los siguientes resultados...

  1. Valorar la relevancia de los avances del campo.
  2. Planificar el clonaje molecular de un gen, realizar experimentos de mutagenesis dirigida, análisis genético de enfermedades, su estudio funcional, plantear los métodos a utilizar, llevarlos a cabo, e interpretar los resultados.
  3. Búsqueda, análisis de  información específica y transmisión de aspectos  de la biología molecular y celular.
  4. Resolver problemas específicos que pueden surgir en un laboratorio de biología molecular y celular
  5. Presentar trabajos realizados de forma individual

2.3. Importancia de los resultados de aprendizaje

Como resultado del aprendizaje de esta asignatura, el alumno deberá ser capaz de seleccionar la técnica mas adecuada cuando se le plantee un problema a resolver en la identificacion de células, genes, proteínas o metabolitos. A su vez sabrá como abordar de forma mas eficiente la caracterizacion de las distintas células y biomoleculas

3. Evaluación

3.1. Tipo de pruebas y su valor sobre la nota final y criterios de evaluación para cada prueba

El estudiante deberá demostrar que ha alcanzado los resultados de aprendizaje previstos mediante las siguientes actividades de evaluacion

1. Participación activa en las clases teóricas y seminarios de la asignatura.

Las clases teóricas de la asignatura consisten en lecciones magistrales participativas, en las que se pide la intervención de los alumnos. Se valorará también la participación y discusión en las sesiones de seminarios.

Criterios de valoración y niveles de exigencia:

Se valorará: La respuesta correcta del alumno en relación a:

  •  Conocimientos previos de las clases ya impartidas
  •  Relacionar las distintas partes de la asignatura
  •  Planteamiento de propuestas alternativas a las explicadas  por el profesor barajando otras fuentes de información.

Se puntuará de 0 a 10 y contribuirá en un 15% a la calificación final.

 

2. Presentación de un trabajo individual

Los trabajos versarán sobre una temática relacionada con la asignatura, que cada alumno concretará con el profesor. El trabajo deberá presentarse por escrito y firmado por el alumno.

Criterios de valoración y niveles de exigencia:

La presentación de un trabajo escrito será obligatoria para superar la asignatura. Se puntuará de 0 a 10 y contribuirá en un 45% a la calificación final. Los criterios de valoración son los siguientes: 

  • Coherencia de la información.
  • Claridad de los conceptos.
  • Grado de elaboración de la presentación.
  • Grado de interiorización de los contenidos con análisis crítico y sugerencias propias.

 

3. Realización de una prueba objetiva

La prueba consistirá en una serie de cuestiones cortas y/o preguntas tipo test sobre los contenidos teóricos de la asignatura. Se puntuará de 0 a 10 y contribuirá en un 40% a la calificación final.

La prueba objetiva tendrá lugar el día y hora que se indiquen en la plataforma Moodle de la Universidad de Zaragoza  https://moodle2.unizar.es/add/ y en el moodle de la asignatura. 

Para aprobar la asignatura, es requisito imprescindible superar esta prueba con un mínimo de 4,5 puntos sobre un total de 10. 

Además, para superar esta asignatura, el estudiante deberá alcanzar una puntuación global mínima de 5 puntos sobre un total de 10. 

 

Pruebas para estudiantes no presenciales

 

Para aquellos estudiantes no presenciales se realizarán las siguientes pruebas:

 

1. Presentación de un trabajo individual

El trabajo versará sobre una temática relacionada con la asignatura, que cada alumno concretará con el profesor. El profesor supervisará el trabajo personal del alumno.

Criterios de valoración y niveles de exigencia:

Se puntuará de 0 a 10 y contribuirá en un 40% a la calificación final. Los criterios de valoración son los mismos que para los estudiantes presenciales.

 

2. Realización de una prueba objetiva

La prueba consistirá en una serie de preguntas cortas y/o tipo test sobre los contenidos teóricos de la asignatura. Se puntuará de 0 a 10 y contribuirá en un 60% a la calificación final

 La prueba objetiva tendrá luegar el día y hora que se indique en la plataforma Moodle de la Universidad de Zaragoza  https://moodle2.unizar.es/add/ y en el moodle de la asignatura.  

 

PARA APROBAR LA ASIGNATURA, ES REQUISITO IMPRESCINDIBLE SUPERAR LA PRUEBA ESCRITA DE LA ASIGNATURA CON UN MÍNIMO DE 5 PUNTOS SOBRE UN TOTAL DE 10 .

 

 Además, para superar esta asignatura, el estudiante deberá alcanzar una puntuación global mínima de 5 puntos sobre un total de 10.

 

 

Pruebas para estudiantes que se presenten en otras convocatorias distintas de la primera.

Para aquellos estudiantes que tengan que presentarse en sucesivas convocatorias por no haber superado la asignatura en primera convocatoria, la evaluación consistirá en las mismas pruebas que para los estudiantes de primera convocatoria, con las siguientes particularidades:

  • Aquellos estudiantes que en las convocatorias anteriores hayan obtenido al menos 5 puntos en la presentación del  trabajo individual no tendrán la obligación de presentar un nuevo trabajo.

La fecha y lugar de las convocatorias distintas a la primera se anunciarán en la plataforma Moodle de la Universidad de Zaragoza  https://moodle2.unizar.es/add/ y en el moodle de la asignatura. 

4. Metodología, actividades de aprendizaje, programa y recursos

4.1. Presentación metodológica general

El proceso de aprendizaje que se ha diseñado para esta asignatura se basa en lo siguiente:

Esta asignatura está programada para abordar una intensificación de conocimientos teóricos en contacto con el especialista. Para ello en las clases teóricas están implicados un gran número de profesores con diferentes puntos de vista que permitirán al alumno una visión más amplia del campo.

Esta estrategia permitirá que el alumno revise un tema en estrecho contacto con un destacado profesional que le acercará a un aspecto de investigación lo que puede facilitarle un posterior desarrollo profesional en el campo a la hora de elegir y llevar a cabo su proyecto de Tesis Doctoral.

4.2. Actividades de aprendizaje

El programa que se ofrece al estudiante para ayudarle a lograr los resultados previstos comprende las siguientes actividades...

1. Actividad presencial: Clases teóricas, exposición y discusión de casos prácticos.

Presencial. 30 horas. Clases magistrales participativas. En ellas se presentan a los alumnos los conocimientos teóricos básicos de la asignatura. Las 2 últimas sesiones se dedicarán a la resolución de casos prácticos.

2. Seminarios 

Presencial. 10 horas

3. Presentación de un trabajo.

No presencial, 30 horas. Esta actividad consiste en que los alumnos recopilarán información sobre un tema concreto, ayudados por el profesor. El profesor supervisará el trabajo individual de los alumnos mediante la programación de sesiones de tutorías. Finalmente, los trabajos se presentarán al profesor.

3. Tutorías.

10 horas de tutorización.

4. Realización de una prueba objetiva para estudios no presenciales.

Presencial, 1 hora; no presencial, 40 horas.

4.3. Programa

Coordinadora: Dr. María F. Fillat

 

Durante las sesiones teóricas se tratarán los temas enumerados a continuación. IMPORTANTE: El orden de exposición de los mismos, así como la temática puede cambiar dependiendo de las agendas de los investigadores invitados. 

1. Presentación de la asignatura. Introducción a la Biología Molecular/Celular y sus aplicaciones. Análisis crítico de las tecnologías para la investigación en ácidos nucleicos.

2. Análisis funcional de promotores. Técnicas de estudio de la interacción DNA-proteína. Aplicaciones.

3. Regulones bacterianos: métodos de estudio

4. Reguladores transcripcionales como dianas antimicrobianas

5. Vacunas en el siglo XXI

6. Aplicaciones de la Citometría de flujo

7. Microscopía óptica multidimensional

8. Métodos de estudio de los miRNAs. Aplicaciones.

9. Sistemas de dos componentes

10. Técnicas de proteómica/inmunoquímica

11. Nuevas técnicas de secuenciación del DNA

12. Análisis de función OxPhos. Generación de mutantes en el DNA mitocondrial. Polarografía. Síntesis mitocondrial de proteínas (35S)

13. Proteómica mitocondrial mediante captura de genes (Gene-trap)

14. Organ on chip: Dispositivos microfluídicos para simular el microentorno en modelos in vitro de cáncer

15. Epigenética: Conceptos, técnicas de análisis y aplicaciones biomédicas

16. Casos prácticos

4.4. Planificación de las actividades de aprendizaje y calendario de fechas clave

Calendario de sesiones presenciales y presentación de trabajos

Clases teóricas, casos prácticos y seminarios:

Primer Semestre, empezarán la segunda quincena de Octubre

Horario: de 16:00 a 18:00 h.

Lugar: pendiente de confirmación. Se indicará en la web de la Facultad de Ciencias.

Presentación y exposición de trabajos

Durante el periodo docente, los alumnos se podrán en contacto con el profesor que les haya expuesto el tema de su interés  para seleccionar su trabajo.

Fecha límite para presentación de los trabajos escritos: Último día lectivo antes de las vacaciones de Navidad

Tutorías (supervisión y revisión de trabajos): se informará en clase

 

 

 

Clases teóricas, casos prácticos y seminarios: Primer semestre de  16-18h.

Fecha límite para presentación de los trabajos escritos: último día lectivo antes de las vacaciones de Navidad

Tutorías (revisión de trabajos presentados): se indicará en clase

 

4.5. Bibliografía y recursos recomendados

  • Los registros bibliográficos para esta asignatura se indicarán en cada sesión teóricas
  • Se dispondrá de las diapositivas de las lecciones en el enlace Moodle de la asignatura